Καλησπέρα,
Σύμφωνά με το ωρολόγιο πρόγραμμα, θα πρέπει να γίνουν 3 εργαστηριακές ασκήσεις. Σε αυτές θα πρέπει να εξασφαλίσετε ότι θα δουλέψετε σε δικό σας υπολογιστή (όχι σε κινητό). Οι απαιτήσεις δεν είναι μεγάλες, οποιοσδήποτε προσωπικός υπολογιστής αρκεί.
Στον υπολογιστή σας, αν χρησιμοποιείτε κάποιο Linux-like λειτουργικό σύστημα (Linux, Mac) θα πρέπει να ελέγξετε ότι η γλώσσα προγραμματισμού Perl υπάρχει και λειτουργεί. Αν χρησιμοποείτε λειτουργικό σύστημα Windows μπορείτε να εγκαταστήσετε το Windows Subsystem for Linux, ή καποιο είδος bash shell (Git Bash, Cygwin, minGW κ.ο.κ.), Επίσης θα πρέπει να διαθέτετε κάποιον text editor, προτείνεται ο VsCode (https://code.visualstudio.com/), αλλά οποιοσδήποτε άλλος editor σας βολεύει, είναι αποδεκτός (ακόμα και το Notepad, αν και δεν προτείνεται, αν θέλετε κατι εξισου απλό αλλά καλό βάλτε Notepad++).
Στην ενότητα "Πρόσθετο Υλικό" κάτω από την περιγραφή του μαθήματος, υπάρχουν ήδη tutorials για την γραμμή εντολών (command line) και τις βασικές λειτουργίες διαχείρισης αρχείων στο Linux (και στα παρόμοια συστήματα), όπως και για την Perl. Όσοι δεν έχετε εμπειρία στην γραμμή εντολών, καλό είναι να μελετήσετε τα βασικά από κάποιο από τα tutorials αυτά, και να εξασκηθείτε λίγο, γιατί μέσα στο εργαστήριο δεν προλαβαίνουμε να τα καλύπτουμε όλα.
Στο πρώτο εργαστήριο θα γίνει μια εξοικείωση με την γραμμή εντολών και την Perl και θα δείτε κάποια απλά προγράμματα βιοπληροφορικής που θα μπορείτε να γράψετε εσείς. Στα επόμενα δύο εργαστήρια θα χρησιμοποιήσετε γνωστά εργαλεία βιοπληροφορικής, τόσο από την γραμμή εντολών όσο και από το διαδίκτυο (δεν θα χρειαστεί προγραμματισμός)
