Ανακοινώσεις μαθήματος Υπολογιστική Ανάλυση Βιολογικών Αλληλουχιών

Διάλεξη Α. Περράκη

Mon, 19 Jan 2026 00:47:02 +0300

Την Τετάρτη 21/1/2026 η διάλεξη του Καθ. Α. Περράκη θα ξεκινήσει στις 17.00 και θα διαρκέσει μέχρι τις 19.00. Αν έχετε άλλο μάθημα στις 18.00 θα ολοκληρωθεί στις 18.15 χωρίς διάλειμμα

Εργαστηριακές Ασκήσεις

Thu, 30 Oct 2025 14:48:53 +0300

Καλησπέρα,

Σύμφωνά με το ωρολόγιο πρόγραμμα, θα πρέπει να γίνουν 3 εργαστηριακές ασκήσεις. Σε αυτές θα πρέπει να εξασφαλίσετε ότι θα δουλέψετε σε δικό σας υπολογιστή (όχι σε κινητό). Οι απαιτήσεις δεν είναι μεγάλες, οποιοσδήποτε προσωπικός υπολογιστής αρκεί.

Στον υπολογιστή σας, αν χρησιμοποιείτε κάποιο Linux-like λειτουργικό σύστημα (Linux, Mac) θα πρέπει να ελέγξετε ότι η γλώσσα προγραμματισμού Perl υπάρχει και λειτουργεί. Αν χρησιμοποείτε λειτουργικό σύστημα Windows μπορείτε να εγκαταστήσετε το Windows Subsystem for Linux, ή καποιο είδος bash shell (Git Bash, Cygwin, minGW κ.ο.κ.), Επίσης θα πρέπει να διαθέτετε κάποιον text editor, προτείνεται ο VsCode (https://code.visualstudio.com/), αλλά οποιοσδήποτε άλλος editor σας βολεύει, είναι αποδεκτός (ακόμα και το Notepad, αν και δεν προτείνεται, αν θέλετε κατι εξισου απλό αλλά καλό βάλτε Notepad++).

Στην ενότητα "Πρόσθετο Υλικό" κάτω από την περιγραφή του μαθήματος, υπάρχουν ήδη tutorials για την γραμμή εντολών (command line) και τις βασικές λειτουργίες διαχείρισης αρχείων στο Linux (και στα παρόμοια συστήματα), όπως και για την Perl. Όσοι δεν έχετε εμπειρία στην γραμμή εντολών, καλό είναι να μελετήσετε τα βασικά από κάποιο από τα tutorials αυτά, και να εξασκηθείτε λίγο, γιατί μέσα στο εργαστήριο δεν προλαβαίνουμε να τα καλύπτουμε όλα.

Στο πρώτο εργαστήριο θα γίνει μια εξοικείωση με την γραμμή εντολών και την Perl και θα δείτε κάποια απλά προγράμματα βιοπληροφορικής που θα μπορείτε να γράψετε εσείς. Στα επόμενα δύο εργαστήρια θα χρησιμοποιήσετε γνωστά εργαλεία βιοπληροφορικής, τόσο από την γραμμή εντολών όσο και από το διαδίκτυο (δεν θα χρειαστεί προγραμματισμός)

Διάλεξη 25/1/2022

Wed, 25 Jan 2023 01:23:12 +0300

Λόγω έκτακτης απουσίας του διδάσκοντα για διοικητικούς λόγους, η διάλεξη της 25ης Ιανουαρίου θα πραγματοποιηθεί από την κα Χατζηγεωργίου εξ ολοκλήρου διαδικτυακά μέσω της πλατφόρμας MS-TEAMS

Αξιολόγηση μαθήματος

Mon, 09 Jan 2023 14:58:38 +0300

Καλησπέρα και καλή χρονιά,

Υπενθυμίζω ότι η διαδικασία αξιολόγησης των μαθημάτων συνεχίζεται μέχρι τις 16/1/2023. Επειδη η συμμετοχή των προπτυχιακών και μεταπτυχιακών φοιτητών είναι γενικά μικρή και το βρίσκουμε μπροστά μας σε όλες τις πιστοποιήσεις και τις αξιολογήσεις των ΠΠΣ και ΠΜΣ, θα σας παρακαλούσα, όσοι δεν το έχετε κάνει ήδη, να δαπανήσετε 5 λεπτά και να συμπληρώσετε τα ερωτηματολόγια. Είναι εντελώς ανώνυμα και είναι σημαντικά για τις διαδικασίες του ΔΠΜΣ και του Ιδρύματος συνολικά.

Ευχαριστώ

Εργαστηριακή Άσκηση 14/12/2022

Wed, 14 Dec 2022 12:28:59 +0300

Καλημέρα,

Οι εργαστηριακές ασκήσεις στις 14/12 και 21/12 θα πραγματοποιηθουν μέσω MS-TEAMS

Διαδικτυακή Διάλεξη

Wed, 23 Nov 2022 10:45:12 +0300

Καλησπέρα,

Λόγω ασθένειας, η διάλεξη 23/11 θα πραγματοποιηθεί διαδικτυακά.

Διαδικτυακή διάλεξη

Wed, 16 Nov 2022 12:56:30 +0300

Λόγω ασθένειας του διδάσκοντα (COVID-19), η σημερινή διάλεξη θα γινει διαδικτυακά μέσω MS TEAMS

Διάλεξη αναπλήρωσης 2/2/2022

Tue, 01 Feb 2022 19:54:15 +0300

Η τελευταία διάλεξη του εξαμήνου (αναπλήρωση) την Τετάρτη 2/2/2022 θα πραγματοποιηθεί μέσω της πλατφόρμας MS TEAMS.

Διάλεξη 26/1/2022

Wed, 26 Jan 2022 03:20:05 +0300

Η διάλεξη της Τετάρτης 26/1/2022 θα πραγματοποιηθεί από την Καθηγήτρια κα Χατζηγεωργίου μέσω του MS TEAMS

Εργαστηριακή Άσκηση 19/1/2022

Tue, 18 Jan 2022 21:43:09 +0300

Η 2η εργαστηριακή άσκηση (19/1/2022) θα διενεργηθεί διαδικτυακά μέσω της πλατφόρμας MS-TEAMS. Δεν θα χρειαστείτε άλλο λογισμικό παρά μόνο έναν browser για να μπορέσετε να χρησιμοποιήσετε τα διαδικτυακά εργαλεία που θα παρουσιαστούν στην άσκηση.

Διάλεξη 12/1

Wed, 12 Jan 2022 14:33:52 +0300

Καλησπέρα και καλή χρονιά., έχω λάβει πολλά αιτήματα λόγω ασθένειας, οπότε καλό είναι το σημερινό μάθημα να γίνει εξ ολοκλήρου διαδικτυακά. Παρακαλώ ειδοποιείστε όσους ξερετε οτι θα έρθουν για δια ζώσης

Εργαστήριο 22/12/2021

Tue, 21 Dec 2021 19:22:50 +0300

Καλησπέρα σε όλους, το αυριανό εργαστηριακό μάθημα θα πραγματοποιηθεί στο εργαστήριο 3 στο ισόγειο του τμήματος Πληροφορικής με Εφαρμογές στη Βιοϊατρική.

Η διδάσκουσα

Παναγιώτα Κοντού

παράταση παράδοσης εργασίας non-coding

Thu, 18 Feb 2021 16:36:29 +0300

Γεια σας

Λόγω καιρικών συνθηκών η εργασία non-coding παίρνει παράταση παράδοσης μέχρι Δευτέρα 22/2 (βράδυ 23:55)

Άρτεμις Χατζηγεωργίου

Εργασια non-coding

Sat, 30 Jan 2021 11:21:18 +0300

Έχετε να κάνετε 2 από τις 3 ασκήσεις μέχρι τις 18/2/21 του αρχείου Exercise_Bioinformatics_2021

Καλή επιτυχία την Δευτέρα

Αρτεμις Χατζηγεωργίου

Εργασία σχετικά με τα εργαστηρία στοιχισης αλληλουχιών και προγνωστικών μεθόδων

Wed, 27 Jan 2021 19:26:35 +0300

Καλησπέρα σε όλους, στην ενότητα "Εργασίες" έχει αναρτηθεί η εργασία η οποία αφορά τα 2 εργαστήρια τα οποία κάναμε μαζί. Πιο συγκεκριμένα θα πρέπει να παραδώσετε μια γραπτή αναφορά σε ένα αρχείο word/pdf στην οποία θα εκτελείτε ένα παραδειγμα χρήσης των εργαλείων των οποίων διδαχθήκατε στα 2 εργαστήρια. Το υλικό του εργαστηριου καθώς και διάφορες αλληλουχίες πρωτεινων σε μορφή fasta έχουν αναρτηθεί στην αντίστοιχη θεματική ενότητα του μαθήματος αλλά και στα έγγραφα.

Η εργασία θα πρέπει να παραδοθεί μέχρι τις 15/2/2021

Καλή συνέχεια σε όλους

Παναγιώτα Κοντού

Αναπλήρωση εργαστηριακής άσκησης

Wed, 23 Dec 2020 18:30:19 +0300

Η εργαστηριακή άσκηση θα αναπληρωθεί την Παρασκευή 15 Ιανουαρίου 2021, 6-9. Η αλλη ασκηση θα γινει κανονικά σύμφωνα με το πρόγραμμα την Τετάρτη 13 Ιανουαρίου.

ΜΑΘΗΜΑΤΑ ΣΤΟ MS TEAMS

Wed, 04 Nov 2020 17:35:20 +0300

Καλησπέρα,

Οπως έχετε ήδη ενημερωθεί το μάθημα πλέον (αφού έχετε όλοι τους κωδικούς σας) θα γίνεται στο MS-TEAMS (κωδικός m8fdcmm)

ΠΜ

Επαναληπτική Εξέταση

Thu, 17 Sep 2020 16:38:45 +0300

Καλησπέρα,

Ελπίζω να έχετε δει όλοι τις διαθέσιμες μεθόδους εξέτασης από απόσταση. Η εξέταση στο μάθημα "Μεθοδολογία Έρευνας" θα γίνειμε ερωτηματολόγιο MS FORMS. Υπενθυμίζω ότι κατά τη διάρκεια της εξέτασης θα πρέπει να είστε συνδεδεμένοι στο MS TEAMS στην αντίστοιχη ομάδα που έχει δημιουργηθεί και στην οποία θα γίνει η ταυτοποίηση και η επιτήρηση. Ο Κωδικός της Ομάδας είναι

g9b60xs

Στην αρχή της διαδικασίας θα πρέπει να ανοίξετε τις κάμερες για να δούμε ότι είστε εσείς ενώ αντίστοιχα αιτήματα θα γίνονται από τους επιτηρητές σε τυχαία διαστήματα. Επίσης, θα ήθελα να έχετε ανοιχτά τα μικρόφωνα κατα τη διάρκεια της εξέτασης (αλλά να κάνετε ησυχία, παρόλα αυτά, οπως ακριβώς και στην τάξη).

Καλή επιτυχία